Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GYS2P54840 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GYS2P54840 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GYS2P54840 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GYS2P54840 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GYS2P54840 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GYS2P54840 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GYS2P54840 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GYS2P54840 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GYS2P54840 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GYS2P54840 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GYS2P54840 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GYS2P54840 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GYS2P54840 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GYS2P54840 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GYS2P54840 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GYS2P54840 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GYS2P54840 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GYS2P54840 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GYS2P54840 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GYS2P54840 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GYS2P54840 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GYS2P54840 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GYS2P54840 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GYS2P54840 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GYS2P54840 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GYS2P54840 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GYS2P54840 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GYS2P54840 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GYS2P54840 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GYS2P54840 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GYS2P54840 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GYS2P54840 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GYS2P54840 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GYS2P54840 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GYS2P54840 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GYS2P54840 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GYS2P54840 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GYS2P54840 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GYS2P54840 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GYS2P54840 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GYS2P54840 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GYS2P54840 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GYS2P54840 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GYS2P54840 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GYS2P54840 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GYS2P54840 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GYS2P54840 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GYS2P54840 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GYS2P54840 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GYS2P54840 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GYS2P54840 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GYS2P54840 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GYS2P54840 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GYS2P54840 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GYS2P54840 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GYS2P54840 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GYS2P54840 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GYS2P54840 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GYS2P54840 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GYS2P54840 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GYS2P54840 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GYS2P54840 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GYS2P54840 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GYS2P54840 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GYS2P54840 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GYS2P54840 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GYS2P54840 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GYS2P54840 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GYS2P54840 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GYS2P54840 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GYS2P54840 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GYS2P54840 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GYS2P54840 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GYS2P54840 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GYS2P54840 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GYS2P54840 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GYS2P54840 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GYS2P54840 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GYS2P54840 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GYS2P54840 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GYS2P54840 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GYS2P54840 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GYS2P54840 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GYS2P54840 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GYS2P54840 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GYS2P54840 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GYS2P54840 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GYS2P54840 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GYS2P54840 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GYS2P54840 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GYS2P54840 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GYS2P54840 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GYS2P54840 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GYS2P54840 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GYS2P54840 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GYS2P54840 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GYS2P54840 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GYS2P54840 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GYS2P54840 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms