Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC41.83■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC41.83■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC41.82■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
SMARCA2P51531 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
SMARCA2P51531 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC41.81■■■■■ 4.28
SMARCA2P51531 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
SMARCA2P51531 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
SMARCA2P51531 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
SMARCA2P51531 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
SMARCA2P51531 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
SMARCA2P51531 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
SMARCA2P51531 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
SMARCA2P51531 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
SMARCA2P51531 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
SMARCA2P51531 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
SMARCA2P51531 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC41.79■■■■■ 4.28
SMARCA2P51531 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
SMARCA2P51531 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
SMARCA2P51531 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC41.78■■■■■ 4.28
SMARCA2P51531 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
SMARCA2P51531 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
SMARCA2P51531 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
SMARCA2P51531 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
SMARCA2P51531 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
SMARCA2P51531 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
SMARCA2P51531 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
SMARCA2P51531 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
SMARCA2P51531 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
SMARCA2P51531 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
SMARCA2P51531 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
SMARCA2P51531 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
SMARCA2P51531 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
SMARCA2P51531 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC41.75■■■■■ 4.27
SMARCA2P51531 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
SMARCA2P51531 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC41.75■■■■■ 4.27
SMARCA2P51531 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
SMARCA2P51531 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
SMARCA2P51531 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
SMARCA2P51531 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
SMARCA2P51531 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
SMARCA2P51531 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
SMARCA2P51531 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
SMARCA2P51531 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
SMARCA2P51531 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
SMARCA2P51531 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
SMARCA2P51531 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
SMARCA2P51531 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
SMARCA2P51531 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC41.71■■■■■ 4.27
SMARCA2P51531 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
SMARCA2P51531 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
SMARCA2P51531 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
SMARCA2P51531 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
SMARCA2P51531 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
SMARCA2P51531 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
SMARCA2P51531 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
SMARCA2P51531 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
SMARCA2P51531 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
SMARCA2P51531 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
SMARCA2P51531 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
SMARCA2P51531 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.69■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC41.69■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms