Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TUBP50607 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBP50607 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBP50607 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TUBP50607 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBP50607 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBP50607 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBP50607 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBP50607 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBP50607 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBP50607 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBP50607 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBP50607 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBP50607 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBP50607 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBP50607 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBP50607 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUBP50607 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBP50607 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBP50607 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBP50607 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBP50607 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBP50607 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TUBP50607 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBP50607 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBP50607 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBP50607 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBP50607 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUBP50607 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBP50607 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBP50607 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBP50607 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBP50607 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBP50607 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBP50607 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBP50607 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBP50607 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBP50607 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBP50607 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUBP50607 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBP50607 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBP50607 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBP50607 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBP50607 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBP50607 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBP50607 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBP50607 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBP50607 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBP50607 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBP50607 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBP50607 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBP50607 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBP50607 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBP50607 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUBP50607 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBP50607 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBP50607 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBP50607 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBP50607 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBP50607 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBP50607 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBP50607 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBP50607 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBP50607 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBP50607 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBP50607 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBP50607 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBP50607 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBP50607 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBP50607 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBP50607 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBP50607 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBP50607 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBP50607 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBP50607 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBP50607 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBP50607 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBP50607 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBP50607 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBP50607 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBP50607 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBP50607 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBP50607 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBP50607 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBP50607 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBP50607 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBP50607 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBP50607 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBP50607 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBP50607 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBP50607 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBP50607 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBP50607 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBP50607 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TUBP50607 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TUBP50607 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TUBP50607 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBP50607 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBP50607 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBP50607 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms