Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERFP50548 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERFP50548 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ERFP50548 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERFP50548 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERFP50548 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERFP50548 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERFP50548 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERFP50548 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERFP50548 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERFP50548 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERFP50548 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERFP50548 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERFP50548 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ERFP50548 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERFP50548 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERFP50548 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERFP50548 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERFP50548 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERFP50548 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERFP50548 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERFP50548 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERFP50548 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERFP50548 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERFP50548 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERFP50548 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERFP50548 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERFP50548 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERFP50548 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ERFP50548 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERFP50548 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERFP50548 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERFP50548 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERFP50548 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERFP50548 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERFP50548 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERFP50548 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERFP50548 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERFP50548 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERFP50548 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERFP50548 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERFP50548 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERFP50548 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERFP50548 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERFP50548 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERFP50548 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERFP50548 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERFP50548 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERFP50548 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERFP50548 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERFP50548 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERFP50548 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERFP50548 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERFP50548 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERFP50548 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERFP50548 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERFP50548 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERFP50548 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERFP50548 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERFP50548 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERFP50548 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERFP50548 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERFP50548 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERFP50548 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERFP50548 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERFP50548 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERFP50548 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERFP50548 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERFP50548 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERFP50548 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERFP50548 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERFP50548 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERFP50548 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERFP50548 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERFP50548 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERFP50548 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERFP50548 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERFP50548 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERFP50548 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERFP50548 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERFP50548 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERFP50548 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERFP50548 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERFP50548 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERFP50548 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERFP50548 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERFP50548 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERFP50548 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERFP50548 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERFP50548 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERFP50548 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERFP50548 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERFP50548 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERFP50548 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERFP50548 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERFP50548 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERFP50548 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERFP50548 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERFP50548 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERFP50548 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms