Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSEN2P49810 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSEN2P49810 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PSEN2P49810 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PSEN2P49810 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PSEN2P49810 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PSEN2P49810 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSEN2P49810 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSEN2P49810 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSEN2P49810 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSEN2P49810 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSEN2P49810 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSEN2P49810 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSEN2P49810 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSEN2P49810 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PSEN2P49810 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSEN2P49810 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PSEN2P49810 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSEN2P49810 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSEN2P49810 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSEN2P49810 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PSEN2P49810 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSEN2P49810 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PSEN2P49810 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSEN2P49810 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSEN2P49810 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSEN2P49810 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSEN2P49810 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSEN2P49810 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSEN2P49810 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSEN2P49810 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSEN2P49810 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSEN2P49810 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSEN2P49810 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms