Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
RARRES1P49788 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RARRES1P49788 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms