Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC11A1P49279 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC11A1P49279 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC11A1P49279 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms