Protein–RNA interactions for Protein: P49238

CX3CR1, CX3C chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CX3CR1P49238 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CX3CR1P49238 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CX3CR1P49238 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CX3CR1P49238 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CX3CR1P49238 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CX3CR1P49238 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CX3CR1P49238 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CX3CR1P49238 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CX3CR1P49238 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CX3CR1P49238 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CX3CR1P49238 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CX3CR1P49238 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CX3CR1P49238 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CX3CR1P49238 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CX3CR1P49238 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CX3CR1P49238 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CX3CR1P49238 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CX3CR1P49238 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CX3CR1P49238 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CX3CR1P49238 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CX3CR1P49238 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CX3CR1P49238 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.9 ms