Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSSP48449 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSSP48449 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LSSP48449 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSSP48449 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSSP48449 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSSP48449 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSSP48449 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSSP48449 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSSP48449 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LSSP48449 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSSP48449 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSSP48449 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSSP48449 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSSP48449 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSSP48449 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSSP48449 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LSSP48449 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSSP48449 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSSP48449 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSSP48449 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSSP48449 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSSP48449 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSSP48449 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSSP48449 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSSP48449 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSSP48449 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSSP48449 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSSP48449 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSSP48449 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSSP48449 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LSSP48449 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LSSP48449 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LSSP48449 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSSP48449 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSSP48449 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSSP48449 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSSP48449 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LSSP48449 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LSSP48449 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSSP48449 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSSP48449 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSSP48449 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSSP48449 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSSP48449 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSSP48449 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSSP48449 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSSP48449 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSSP48449 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSSP48449 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSSP48449 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSSP48449 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSSP48449 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSSP48449 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSSP48449 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSSP48449 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSSP48449 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LSSP48449 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSSP48449 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSSP48449 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSSP48449 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSSP48449 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSSP48449 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSSP48449 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSSP48449 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSSP48449 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSSP48449 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSSP48449 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSSP48449 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSSP48449 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSSP48449 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSSP48449 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LSSP48449 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSSP48449 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LSSP48449 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSSP48449 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSSP48449 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSSP48449 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSSP48449 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSSP48449 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSSP48449 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSSP48449 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSSP48449 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSSP48449 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSSP48449 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LSSP48449 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LSSP48449 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LSSP48449 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSSP48449 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSSP48449 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LSSP48449 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LSSP48449 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSSP48449 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSSP48449 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSSP48449 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSSP48449 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSSP48449 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSSP48449 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSSP48449 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSSP48449 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms