Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARCN1P48444 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARCN1P48444 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARCN1P48444 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms