Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACADSBP45954 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACADSBP45954 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACADSBP45954 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 482.4 ms