Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
NCAPD3P42695 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
NCAPD3P42695 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
NCAPD3P42695 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
NCAPD3P42695 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
NCAPD3P42695 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
NCAPD3P42695 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
NCAPD3P42695 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
NCAPD3P42695 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
NCAPD3P42695 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
NCAPD3P42695 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
NCAPD3P42695 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
NCAPD3P42695 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
NCAPD3P42695 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
NCAPD3P42695 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
NCAPD3P42695 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
NCAPD3P42695 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
NCAPD3P42695 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.27
NCAPD3P42695 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
NCAPD3P42695 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
NCAPD3P42695 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
NCAPD3P42695 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
NCAPD3P42695 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
NCAPD3P42695 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
NCAPD3P42695 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
NCAPD3P42695 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
NCAPD3P42695 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
NCAPD3P42695 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
NCAPD3P42695 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
NCAPD3P42695 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
NCAPD3P42695 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
NCAPD3P42695 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.72■■■■■ 4.27
NCAPD3P42695 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
NCAPD3P42695 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
NCAPD3P42695 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
NCAPD3P42695 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
NCAPD3P42695 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
NCAPD3P42695 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
NCAPD3P42695 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
NCAPD3P42695 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
NCAPD3P42695 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
NCAPD3P42695 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
NCAPD3P42695 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
NCAPD3P42695 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
NCAPD3P42695 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC41.69■■■■■ 4.26
NCAPD3P42695 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
NCAPD3P42695 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
NCAPD3P42695 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
NCAPD3P42695 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.67■■■■■ 4.26
NCAPD3P42695 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
NCAPD3P42695 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
NCAPD3P42695 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
NCAPD3P42695 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
NCAPD3P42695 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
NCAPD3P42695 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
NCAPD3P42695 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
NCAPD3P42695 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
NCAPD3P42695 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
NCAPD3P42695 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
NCAPD3P42695 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
NCAPD3P42695 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
NCAPD3P42695 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
NCAPD3P42695 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
NCAPD3P42695 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
NCAPD3P42695 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
NCAPD3P42695 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC41.62■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC41.62■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC41.61■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC41.6■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC41.6■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
NCAPD3P42695 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms