Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFSF9P41273 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFSF9P41273 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFSF9P41273 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms