Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RFC5P40937 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFC5P40937 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFC5P40937 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFC5P40937 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFC5P40937 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFC5P40937 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFC5P40937 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFC5P40937 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFC5P40937 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RFC5P40937 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFC5P40937 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFC5P40937 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFC5P40937 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFC5P40937 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFC5P40937 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFC5P40937 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFC5P40937 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFC5P40937 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFC5P40937 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RFC5P40937 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFC5P40937 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFC5P40937 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFC5P40937 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFC5P40937 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFC5P40937 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFC5P40937 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFC5P40937 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFC5P40937 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFC5P40937 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFC5P40937 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFC5P40937 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFC5P40937 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFC5P40937 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFC5P40937 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFC5P40937 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFC5P40937 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFC5P40937 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFC5P40937 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFC5P40937 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFC5P40937 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RFC5P40937 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RFC5P40937 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFC5P40937 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFC5P40937 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFC5P40937 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFC5P40937 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFC5P40937 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFC5P40937 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFC5P40937 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFC5P40937 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RFC5P40937 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFC5P40937 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFC5P40937 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFC5P40937 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFC5P40937 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFC5P40937 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFC5P40937 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFC5P40937 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RFC5P40937 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFC5P40937 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFC5P40937 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFC5P40937 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFC5P40937 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFC5P40937 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RFC5P40937 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFC5P40937 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFC5P40937 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFC5P40937 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFC5P40937 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFC5P40937 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RFC5P40937 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFC5P40937 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RFC5P40937 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFC5P40937 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFC5P40937 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFC5P40937 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFC5P40937 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFC5P40937 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFC5P40937 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFC5P40937 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFC5P40937 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFC5P40937 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFC5P40937 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFC5P40937 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RFC5P40937 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFC5P40937 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFC5P40937 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFC5P40937 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RFC5P40937 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFC5P40937 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFC5P40937 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFC5P40937 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFC5P40937 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFC5P40937 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFC5P40937 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFC5P40937 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFC5P40937 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFC5P40937 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFC5P40937 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms