Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
THPOP40225 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
THPOP40225 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
THPOP40225 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
THPOP40225 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
THPOP40225 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
THPOP40225 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
THPOP40225 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
THPOP40225 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
THPOP40225 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
THPOP40225 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
THPOP40225 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
THPOP40225 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
THPOP40225 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
THPOP40225 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
THPOP40225 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
THPOP40225 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
THPOP40225 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
THPOP40225 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
THPOP40225 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
THPOP40225 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
THPOP40225 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
THPOP40225 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
THPOP40225 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
THPOP40225 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
THPOP40225 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
THPOP40225 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
THPOP40225 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
THPOP40225 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
THPOP40225 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
THPOP40225 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
THPOP40225 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
THPOP40225 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
THPOP40225 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
THPOP40225 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
THPOP40225 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
THPOP40225 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
THPOP40225 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
THPOP40225 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
THPOP40225 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
THPOP40225 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
THPOP40225 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
THPOP40225 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
THPOP40225 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
THPOP40225 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
THPOP40225 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
THPOP40225 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
THPOP40225 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
THPOP40225 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
THPOP40225 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
THPOP40225 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
THPOP40225 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
THPOP40225 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
THPOP40225 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
THPOP40225 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
THPOP40225 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
THPOP40225 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
THPOP40225 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
THPOP40225 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
THPOP40225 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
THPOP40225 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
THPOP40225 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
THPOP40225 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
THPOP40225 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
THPOP40225 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
THPOP40225 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
THPOP40225 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
THPOP40225 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
THPOP40225 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
THPOP40225 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
THPOP40225 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
THPOP40225 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
THPOP40225 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
THPOP40225 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
THPOP40225 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
THPOP40225 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
THPOP40225 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
THPOP40225 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
THPOP40225 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
THPOP40225 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
THPOP40225 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
THPOP40225 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
THPOP40225 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
THPOP40225 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
THPOP40225 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
THPOP40225 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
THPOP40225 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
THPOP40225 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
THPOP40225 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
THPOP40225 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
THPOP40225 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
THPOP40225 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
THPOP40225 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
THPOP40225 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
THPOP40225 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
THPOP40225 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
THPOP40225 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
THPOP40225 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
THPOP40225 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
THPOP40225 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms