Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
IGHMBP2P38935 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IGHMBP2P38935 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IGHMBP2P38935 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IGHMBP2P38935 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IGHMBP2P38935 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IGHMBP2P38935 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGHMBP2P38935 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGHMBP2P38935 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGHMBP2P38935 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGHMBP2P38935 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGHMBP2P38935 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGHMBP2P38935 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGHMBP2P38935 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGHMBP2P38935 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
IGHMBP2P38935 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGHMBP2P38935 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGHMBP2P38935 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
IGHMBP2P38935 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IGHMBP2P38935 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IGHMBP2P38935 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IGHMBP2P38935 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
IGHMBP2P38935 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGHMBP2P38935 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGHMBP2P38935 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGHMBP2P38935 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGHMBP2P38935 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGHMBP2P38935 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IGHMBP2P38935 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IGHMBP2P38935 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IGHMBP2P38935 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IGHMBP2P38935 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IGHMBP2P38935 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
IGHMBP2P38935 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IGHMBP2P38935 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IGHMBP2P38935 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IGHMBP2P38935 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IGHMBP2P38935 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IGHMBP2P38935 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
IGHMBP2P38935 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGHMBP2P38935 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGHMBP2P38935 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGHMBP2P38935 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGHMBP2P38935 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGHMBP2P38935 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
IGHMBP2P38935 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
IGHMBP2P38935 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGHMBP2P38935 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGHMBP2P38935 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGHMBP2P38935 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
IGHMBP2P38935 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGHMBP2P38935 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms