Protein–RNA interactions for Protein: P38358

VBA2, Vacuolar basic amino acid transporter 2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VBA2P38358 HSF1YGL073W 2502 nt5.11□□□□□ -1.59
VBA2P38358 STE13YOR219C 2796 nt5.1□□□□□ -1.59
VBA2P38358 TRP4YDR354W 1143 nt5.1□□□□□ -1.59
VBA2P38358 ATO3YDR384C 828 nt5.1□□□□□ -1.59
VBA2P38358 SEC20YDR498C 1152 nt5.1□□□□□ -1.59
VBA2P38358 OKP1YGR179C 1221 nt5.1□□□□□ -1.59
VBA2P38358 COR1YBL045C 1374 nt5.1□□□□□ -1.59
VBA2P38358 GSH2YOL049W 1476 nt5.1□□□□□ -1.59
VBA2P38358 ATG12YBR217W 561 nt5.1□□□□□ -1.59
VBA2P38358 SIT4YDL047W 936 nt5.09□□□□□ -1.59
VBA2P38358 UGX2YDL169C 672 nt5.09□□□□□ -1.59
VBA2P38358 SIP2YGL208W 1248 nt5.09□□□□□ -1.59
VBA2P38358 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt5.09□□□□□ -1.59
VBA2P38358 APS3YJL024C 585 nt5.09□□□□□ -1.59
VBA2P38358 YLR124WYLR124W 345 nt5.09□□□□□ -1.59
VBA2P38358 MRPS8YMR158W 468 nt5.09□□□□□ -1.59
VBA2P38358 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt5.09□□□□□ -1.59
VBA2P38358 YPL168WYPL168W 1293 nt5.09□□□□□ -1.59
VBA2P38358 MNS1YJR131W 1650 nt5.08□□□□□ -1.6
VBA2P38358 MET7YOR241W 1647 nt5.08□□□□□ -1.6
VBA2P38358 YJR124CYJR124C 1347 nt5.08□□□□□ -1.6
VBA2P38358 LSG1YGL099W 1923 nt5.08□□□□□ -1.6
VBA2P38358 YDL114WYDL114W 927 nt5.08□□□□□ -1.6
VBA2P38358 YDL157CYDL157C 357 nt5.08□□□□□ -1.6
VBA2P38358 VAM7YGL212W 951 nt5.08□□□□□ -1.6
VBA2P38358 MND2YIR025W 1107 nt5.08□□□□□ -1.6
VBA2P38358 MET16YPR167C 786 nt5.08□□□□□ -1.6
VBA2P38358 STE12YHR084W 2067 nt5.08□□□□□ -1.6
VBA2P38358 FLC3YGL139W 2409 nt5.07□□□□□ -1.6
VBA2P38358 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt5.07□□□□□ -1.6
VBA2P38358 YDR222WYDR222W 1248 nt5.07□□□□□ -1.6
VBA2P38358 RRP4YHR069C 1080 nt5.07□□□□□ -1.6
VBA2P38358 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt5.07□□□□□ -1.6
VBA2P38358 ANT1YPR128C 987 nt5.07□□□□□ -1.6
VBA2P38358 PPR1YLR014C 2715 nt5.07□□□□□ -1.6
VBA2P38358 MRK1YDL079C 1506 nt5.07□□□□□ -1.6
VBA2P38358 COQ6YGR255C 1440 nt5.06□□□□□ -1.6
VBA2P38358 LYS21YDL131W 1323 nt5.06□□□□□ -1.6
VBA2P38358 YDL026WYDL026W 312 nt5.06□□□□□ -1.6
VBA2P38358 YER138W-AYER138W-A 105 nt5.06□□□□□ -1.6
VBA2P38358 DSD1YGL196W 1287 nt5.06□□□□□ -1.6
VBA2P38358 MRT4YKL009W 711 nt5.06□□□□□ -1.6
VBA2P38358 ARC19YKL013C 516 nt5.06□□□□□ -1.6
VBA2P38358 GEP5YLR091W 882 nt5.06□□□□□ -1.6
VBA2P38358 ECM19YLR390W 339 nt5.06□□□□□ -1.6
VBA2P38358 SNO1YMR095C 675 nt5.06□□□□□ -1.6
VBA2P38358 YIM2YMR151W 438 nt5.06□□□□□ -1.6
VBA2P38358 CTL1YMR180C 963 nt5.06□□□□□ -1.6
VBA2P38358 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt5.06□□□□□ -1.6
VBA2P38358 CSG2YBR036C 1233 nt5.06□□□□□ -1.6
VBA2P38358 ENT2YLR206W 1842 nt5.06□□□□□ -1.6
VBA2P38358 NSI1YDR026C 1713 nt5.06□□□□□ -1.6
VBA2P38358 TBF1YPL128C 1689 nt5.05□□□□□ -1.6
VBA2P38358 SNT2YGL131C 4212 nt5.05□□□□□ -1.6
VBA2P38358 RNR3YIL066C 2610 nt5.05□□□□□ -1.6
VBA2P38358 YCL065WYCL065W 369 nt5.05□□□□□ -1.6
VBA2P38358 GET3YDL100C 1065 nt5.05□□□□□ -1.6
VBA2P38358 YRA1YDR381W 681 nt5.05□□□□□ -1.6
VBA2P38358 DFM1YDR411C 1026 nt5.05□□□□□ -1.6
VBA2P38358 PRS2YER099C 957 nt5.05□□□□□ -1.6
VBA2P38358 CAF16YFL028C 870 nt5.05□□□□□ -1.6
VBA2P38358 YGR176WYGR176W 348 nt5.05□□□□□ -1.6
VBA2P38358 ASK1YKL052C 879 nt5.05□□□□□ -1.6
VBA2P38358 YKR104WYKR104W 921 nt5.05□□□□□ -1.6
VBA2P38358 YLR198CYLR198C 360 nt5.05□□□□□ -1.6
VBA2P38358 YLR225CYLR225C 1224 nt5.05□□□□□ -1.6
VBA2P38358 DIA1YMR316W 1011 nt5.05□□□□□ -1.6
VBA2P38358 RBD2YPL246C 789 nt5.05□□□□□ -1.6
VBA2P38358 ALT1YLR089C 1779 nt5.05□□□□□ -1.6
VBA2P38358 GYP1YOR070C 1914 nt5.05□□□□□ -1.6
VBA2P38358 ISN1YOR155C 1353 nt5.04□□□□□ -1.6
VBA2P38358 STL1YDR536W 1710 nt5.04□□□□□ -1.6
VBA2P38358 YDR336WYDR336W 945 nt5.04□□□□□ -1.6
VBA2P38358 IRC6YFR043C 714 nt5.04□□□□□ -1.6
VBA2P38358 GRE3YHR104W 984 nt5.04□□□□□ -1.6
VBA2P38358 YHR214WYHR214W 612 nt5.04□□□□□ -1.6
VBA2P38358 RPR2YIR015W 435 nt5.04□□□□□ -1.6
VBA2P38358 DAN1YJR150C 897 nt5.04□□□□□ -1.6
VBA2P38358 YLL047WYLL047W 384 nt5.04□□□□□ -1.6
VBA2P38358 HCR1YLR192C 798 nt5.04□□□□□ -1.6
VBA2P38358 YAR066WYAR066W 612 nt5.04□□□□□ -1.6
VBA2P38358 LTO1YNL260C 597 nt5.04□□□□□ -1.6
VBA2P38358 RPS15YOL040C 429 nt5.04□□□□□ -1.6
VBA2P38358 YHL012WYHL012W 1482 nt5.04□□□□□ -1.6
VBA2P38358 HFI1YPL254W 1467 nt5.04□□□□□ -1.6
VBA2P38358 MUP3YHL036W 1641 nt5.04□□□□□ -1.6
VBA2P38358 PRT1YOR361C 2292 nt5.03□□□□□ -1.6
VBA2P38358 DEG1YFL001W 1329 nt5.03□□□□□ -1.6
VBA2P38358 YDL183CYDL183C 963 nt5.03□□□□□ -1.6
VBA2P38358 YFT2YDR319C 825 nt5.03□□□□□ -1.6
VBA2P38358 COX3Q0275 810 nt5.03□□□□□ -1.6
VBA2P38358 HSP150YJL159W 1242 nt5.03□□□□□ -1.6
VBA2P38358 YLR126CYLR126C 756 nt5.03□□□□□ -1.6
VBA2P38358 YLR326WYLR326W 723 nt5.03□□□□□ -1.6
VBA2P38358 TGL1YKL140W 1647 nt5.03□□□□□ -1.6
VBA2P38358 IXR1YKL032C 1794 nt5.03□□□□□ -1.6
VBA2P38358 TRP3YKL211C 1455 nt5.02□□□□□ -1.61
VBA2P38358 VAN1YML115C 1608 nt5.02□□□□□ -1.61
VBA2P38358 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt5.02□□□□□ -1.61
VBA2P38358 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 203.6 ms