Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ZEB1P37275 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ZEB1P37275 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.05
ZEB1P37275 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ZEB1P37275 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ZEB1P37275 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ZEB1P37275 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ZEB1P37275 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ZEB1P37275 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ZEB1P37275 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ZEB1P37275 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ZEB1P37275 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ZEB1P37275 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ZEB1P37275 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ZEB1P37275 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ZEB1P37275 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms