Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP214P35658 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP214P35658 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP214P35658 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP214P35658 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP214P35658 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP214P35658 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP214P35658 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP214P35658 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP214P35658 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP214P35658 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP214P35658 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP214P35658 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP214P35658 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP214P35658 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP214P35658 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP214P35658 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP214P35658 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP214P35658 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP214P35658 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP214P35658 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP214P35658 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP214P35658 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP214P35658 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP214P35658 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP214P35658 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP214P35658 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP214P35658 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP214P35658 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP214P35658 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP214P35658 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP214P35658 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP214P35658 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP214P35658 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP214P35658 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP214P35658 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP214P35658 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP214P35658 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP214P35658 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP214P35658 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP214P35658 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP214P35658 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP214P35658 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP214P35658 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP214P35658 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP214P35658 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP214P35658 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP214P35658 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP214P35658 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP214P35658 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP214P35658 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP214P35658 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP214P35658 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP214P35658 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP214P35658 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP214P35658 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NUP214P35658 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NUP214P35658 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP214P35658 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP214P35658 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP214P35658 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP214P35658 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP214P35658 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP214P35658 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP214P35658 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP214P35658 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP214P35658 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP214P35658 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP214P35658 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP214P35658 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP214P35658 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP214P35658 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP214P35658 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP214P35658 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP214P35658 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP214P35658 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP214P35658 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP214P35658 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP214P35658 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP214P35658 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP214P35658 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP214P35658 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP214P35658 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP214P35658 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP214P35658 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP214P35658 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP214P35658 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP214P35658 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP214P35658 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP214P35658 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP214P35658 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP214P35658 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP214P35658 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP214P35658 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP214P35658 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP214P35658 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP214P35658 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP214P35658 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP214P35658 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP214P35658 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms