Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
DDIT3P35638 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDIT3P35638 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDIT3P35638 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDIT3P35638 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDIT3P35638 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
DDIT3P35638 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDIT3P35638 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDIT3P35638 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDIT3P35638 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDIT3P35638 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDIT3P35638 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDIT3P35638 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDIT3P35638 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDIT3P35638 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDIT3P35638 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
DDIT3P35638 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDIT3P35638 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDIT3P35638 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDIT3P35638 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDIT3P35638 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDIT3P35638 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDIT3P35638 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDIT3P35638 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDIT3P35638 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDIT3P35638 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDIT3P35638 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms