Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA4P35212 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA4P35212 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA4P35212 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA4P35212 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA4P35212 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA4P35212 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA4P35212 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA4P35212 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA4P35212 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA4P35212 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA4P35212 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA4P35212 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA4P35212 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA4P35212 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA4P35212 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA4P35212 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA4P35212 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA4P35212 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA4P35212 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA4P35212 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA4P35212 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA4P35212 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA4P35212 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA4P35212 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA4P35212 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA4P35212 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA4P35212 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA4P35212 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA4P35212 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJA4P35212 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJA4P35212 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJA4P35212 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJA4P35212 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJA4P35212 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJA4P35212 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJA4P35212 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA4P35212 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA4P35212 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA4P35212 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA4P35212 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA4P35212 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJA4P35212 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA4P35212 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA4P35212 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA4P35212 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA4P35212 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA4P35212 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA4P35212 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA4P35212 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA4P35212 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA4P35212 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA4P35212 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA4P35212 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA4P35212 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJA4P35212 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA4P35212 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA4P35212 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA4P35212 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA4P35212 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA4P35212 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA4P35212 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA4P35212 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA4P35212 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA4P35212 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA4P35212 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA4P35212 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJA4P35212 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA4P35212 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA4P35212 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA4P35212 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA4P35212 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA4P35212 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA4P35212 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA4P35212 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJA4P35212 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA4P35212 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA4P35212 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA4P35212 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA4P35212 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA4P35212 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA4P35212 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA4P35212 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA4P35212 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJA4P35212 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA4P35212 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA4P35212 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA4P35212 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA4P35212 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA4P35212 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA4P35212 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA4P35212 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA4P35212 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA4P35212 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA4P35212 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJA4P35212 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA4P35212 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA4P35212 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA4P35212 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA4P35212 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms