Protein–RNA interactions for Protein: P32842

VMA11, V-type proton ATPase subunit c', yeast

Predictions only

Length 164 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA11	P32842	UTR4	YEL038W	684 nt		4.21	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	RPB4	YJL140W	666 nt		4.21	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	MRPL4	YLR439W	960 nt		4.21	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	APJ1	YNL077W	1587 nt		4.21	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	YTA6	YPL074W	2265 nt		4.21	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	PRP43	YGL120C	2304 nt		4.21	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	VID30	YGL227W	2877 nt		4.2	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	AFT1	YGL071W	2073 nt		4.2	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	AVT3	YKL146W	2079 nt		4.2	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	ASK10	YGR097W	3441 nt		4.2	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	TUB2	YFL037W	1374 nt		4.2	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	ATG23	YLR431C	1362 nt		4.2	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	RPL12A	YEL054C	498 nt		4.2	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	CDC43	YGL155W	1131 nt		4.2	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	ZRT1	YGL255W	1131 nt		4.2	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	MRPL15	YLR312W-A	762 nt		4.2	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	REC114	YMR133W	1287 nt		4.2	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	RHO2	YNL090W	579 nt		4.2	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	PGA2	YNL149C	390 nt		4.2	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	YIL067C	YIL067C	2037 nt		4.2	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	SNF3	YDL194W	2655 nt		4.2	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	SEC9	YGR009C	1956 nt		4.2	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	COT1	YOR316C	1320 nt		4.2	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	ATG20	YDL113C	1923 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	HFI1	YPL254W	1467 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	LCP5	YER127W	1074 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	JAC1	YGL018C	555 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	YIR017W-A	YIR017W-A	600 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	MND2	YIR025W	1107 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	MRL1	YPR079W	1146 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	YPR098C	YPR098C	486 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	DCC1	YCL016C	1143 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	QDR1	YIL120W	1692 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	MSH1	YHR120W	2880 nt		4.19	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	HXT3	YDR345C	1704 nt		4.18	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	MNN10	YDR245W	1182 nt		4.18	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	YEL053W-A	YEL053W-A	348 nt		4.18	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	ECM15	YBL001C	315 nt		4.18	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	VMA13	YPR036W	1437 nt		4.18	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	PHO90	YJL198W	2646 nt		4.18	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	KIP2	YPL155C	2121 nt		4.18	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	PXA1	YPL147W	2613 nt		4.17	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	RPS16B	YDL083C	432 nt		4.17	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	YFR034W-A	YFR034W-A	288 nt		4.17	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	YJL211C	YJL211C	444 nt		4.17	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	SPG4	YMR107W	348 nt		4.17	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	CKB2	YOR039W	777 nt		4.17	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	NPT1	YOR209C	1290 nt		4.17	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	BLM10	YFL007W	6432 nt		4.17	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	CNM67	YNL225C	1746 nt		4.16	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	LUC7	YDL087C	786 nt		4.16	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	HEM3	YDL205C	984 nt		4.16	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	GLO2	YDR272W	825 nt		4.16	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	YHR145C	YHR145C	357 nt		4.16	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	LEM3	YNL323W	1245 nt		4.16	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	YBR016W	YBR016W	387 nt		4.16	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	YBR126W-A	YBR126W-A	207 nt		4.16	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	DAL81	YIR023W	2913 nt		4.15	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	PAP1	YKR002W	1707 nt		4.15	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	TUL1	YKL034W	2277 nt		4.15	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	SMF3	YLR034C	1422 nt		4.15	□□□□□ -1.74
VMA11	P32842	IPK1	YDR315C	846 nt		4.15	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	MRF1	YGL143C	1242 nt		4.15	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	BGL2	YGR282C	942 nt		4.15	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	ATG33	YLR356W	594 nt		4.15	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	YML101C-A	YML101C-A	318 nt		4.15	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	HOR7	YMR251W-A	180 nt		4.15	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	GRE1	YPL223C	507 nt		4.15	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	TOM5	YPR133W-A	153 nt		4.15	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	KCH1	YJR054W	1494 nt		4.15	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	YMD8	YML038C	1329 nt		4.15	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	PDH1	YPR002W	1551 nt		4.14	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	GPR1	YDL035C	2886 nt		4.14	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	CDC4	YFL009W	2340 nt		4.14	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	SEH1	YGL100W	1050 nt		4.14	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	RPA49	YNL248C	1248 nt		4.14	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	SCO1	YBR037C	888 nt		4.14	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	RPL21B	YPL079W	483 nt		4.14	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	STE50	YCL032W	1041 nt		4.14	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	RPT4	YOR259C	1314 nt		4.14	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	SIF2	YBR103W	1608 nt		4.13	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	SFI1	YLL003W	2841 nt		4.13	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	ARO2	YGL148W	1131 nt		4.13	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	NAG1	YGR031C-A	492 nt		4.13	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	VPS29	YHR012W	849 nt		4.13	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	CBT1	YKL208W	816 nt		4.13	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	SLD7	YOR060C	774 nt		4.13	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	YOR342C	YOR342C	960 nt		4.13	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	GAS3	YMR215W	1575 nt		4.13	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	MSC7	YHR039C	1935 nt		4.13	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	NOP8	YOL144W	1455 nt		4.12	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	URA3	YEL021W	804 nt		4.12	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	SCS2	YER120W	735 nt		4.12	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	BNS1	YGR230W	414 nt		4.12	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	PEX22	YAL055W	543 nt		4.12	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	SKG1	YKR100C	1068 nt		4.12	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	JEM1	YJL073W	1938 nt		4.12	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	RAT1	YOR048C	3021 nt		4.12	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	NGR1	YBR212W	2019 nt		4.12	□□□□□ -1.75
VMA11	P32842	MLF3	YNL074C	1359 nt		4.12	□□□□□ -1.75

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