Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TM4SF1P30408 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TM4SF1P30408 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TM4SF1P30408 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TM4SF1P30408 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TM4SF1P30408 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TM4SF1P30408 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TM4SF1P30408 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TM4SF1P30408 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TM4SF1P30408 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TM4SF1P30408 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TM4SF1P30408 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TM4SF1P30408 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms