Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCND2P30279 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCND2P30279 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCND2P30279 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCND2P30279 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCND2P30279 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCND2P30279 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCND2P30279 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCND2P30279 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCND2P30279 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCND2P30279 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCND2P30279 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCND2P30279 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCND2P30279 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCND2P30279 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCND2P30279 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCND2P30279 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCND2P30279 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCND2P30279 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCND2P30279 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCND2P30279 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCND2P30279 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCND2P30279 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCND2P30279 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCND2P30279 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCND2P30279 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCND2P30279 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCND2P30279 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CCND2P30279 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CCND2P30279 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCND2P30279 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCND2P30279 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCND2P30279 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCND2P30279 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCND2P30279 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCND2P30279 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCND2P30279 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCND2P30279 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCND2P30279 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCND2P30279 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCND2P30279 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCND2P30279 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCND2P30279 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCND2P30279 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCND2P30279 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCND2P30279 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCND2P30279 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCND2P30279 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCND2P30279 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCND2P30279 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCND2P30279 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCND2P30279 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCND2P30279 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCND2P30279 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCND2P30279 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCND2P30279 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCND2P30279 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCND2P30279 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCND2P30279 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCND2P30279 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCND2P30279 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCND2P30279 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCND2P30279 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCND2P30279 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCND2P30279 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCND2P30279 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCND2P30279 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCND2P30279 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCND2P30279 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCND2P30279 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCND2P30279 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCND2P30279 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCND2P30279 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCND2P30279 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCND2P30279 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCND2P30279 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCND2P30279 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCND2P30279 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCND2P30279 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCND2P30279 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCND2P30279 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCND2P30279 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCND2P30279 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCND2P30279 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCND2P30279 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCND2P30279 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCND2P30279 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCND2P30279 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCND2P30279 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCND2P30279 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCND2P30279 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCND2P30279 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCND2P30279 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCND2P30279 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCND2P30279 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCND2P30279 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCND2P30279 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCND2P30279 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCND2P30279 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCND2P30279 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms