Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GTF2E2P29084 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GTF2E2P29084 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms