Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLD1P28340 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLD1P28340 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLD1P28340 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
POLD1P28340 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLD1P28340 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
POLD1P28340 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLD1P28340 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLD1P28340 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLD1P28340 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLD1P28340 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLD1P28340 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLD1P28340 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLD1P28340 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
POLD1P28340 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLD1P28340 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLD1P28340 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLD1P28340 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
POLD1P28340 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLD1P28340 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLD1P28340 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLD1P28340 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
POLD1P28340 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLD1P28340 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLD1P28340 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLD1P28340 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLD1P28340 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLD1P28340 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLD1P28340 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLD1P28340 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
POLD1P28340 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLD1P28340 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLD1P28340 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLD1P28340 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLD1P28340 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLD1P28340 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
POLD1P28340 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLD1P28340 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLD1P28340 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLD1P28340 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLD1P28340 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLD1P28340 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
POLD1P28340 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
POLD1P28340 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
POLD1P28340 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLD1P28340 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLD1P28340 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLD1P28340 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
POLD1P28340 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
POLD1P28340 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLD1P28340 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLD1P28340 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLD1P28340 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
POLD1P28340 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLD1P28340 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLD1P28340 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLD1P28340 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLD1P28340 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLD1P28340 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLD1P28340 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLD1P28340 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLD1P28340 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLD1P28340 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
POLD1P28340 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
POLD1P28340 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLD1P28340 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLD1P28340 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLD1P28340 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLD1P28340 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
POLD1P28340 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLD1P28340 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLD1P28340 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLD1P28340 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLD1P28340 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLD1P28340 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLD1P28340 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLD1P28340 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
POLD1P28340 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
POLD1P28340 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLD1P28340 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLD1P28340 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLD1P28340 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLD1P28340 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLD1P28340 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLD1P28340 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLD1P28340 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
POLD1P28340 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
POLD1P28340 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
POLD1P28340 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
POLD1P28340 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLD1P28340 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLD1P28340 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
POLD1P28340 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLD1P28340 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLD1P28340 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLD1P28340 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLD1P28340 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLD1P28340 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
POLD1P28340 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
POLD1P28340 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms