Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PEX2P28328 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PEX2P28328 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PEX2P28328 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PEX2P28328 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PEX2P28328 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PEX2P28328 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PEX2P28328 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PEX2P28328 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PEX2P28328 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PEX2P28328 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PEX2P28328 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PEX2P28328 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PEX2P28328 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PEX2P28328 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PEX2P28328 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PEX2P28328 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PEX2P28328 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PEX2P28328 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PEX2P28328 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PEX2P28328 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PEX2P28328 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PEX2P28328 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PEX2P28328 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PEX2P28328 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PEX2P28328 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PEX2P28328 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PEX2P28328 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PEX2P28328 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PEX2P28328 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PEX2P28328 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PEX2P28328 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PEX2P28328 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PEX2P28328 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PEX2P28328 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PEX2P28328 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PEX2P28328 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PEX2P28328 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PEX2P28328 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PEX2P28328 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PEX2P28328 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PEX2P28328 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PEX2P28328 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PEX2P28328 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PEX2P28328 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PEX2P28328 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PEX2P28328 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PEX2P28328 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PEX2P28328 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PEX2P28328 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
PEX2P28328 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PEX2P28328 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PEX2P28328 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PEX2P28328 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PEX2P28328 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PEX2P28328 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PEX2P28328 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PEX2P28328 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PEX2P28328 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PEX2P28328 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PEX2P28328 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PEX2P28328 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PEX2P28328 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PEX2P28328 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PEX2P28328 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PEX2P28328 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PEX2P28328 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PEX2P28328 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PEX2P28328 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PEX2P28328 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PEX2P28328 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PEX2P28328 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PEX2P28328 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PEX2P28328 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PEX2P28328 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PEX2P28328 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PEX2P28328 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PEX2P28328 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PEX2P28328 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PEX2P28328 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PEX2P28328 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PEX2P28328 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PEX2P28328 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PEX2P28328 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PEX2P28328 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PEX2P28328 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PEX2P28328 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PEX2P28328 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PEX2P28328 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PEX2P28328 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PEX2P28328 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PEX2P28328 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PEX2P28328 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PEX2P28328 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PEX2P28328 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PEX2P28328 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PEX2P28328 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PEX2P28328 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PEX2P28328 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PEX2P28328 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms