Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
HLA-DMAP28067 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-DMAP28067 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms