Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTAFRP25105 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTAFRP25105 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTAFRP25105 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms