Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAX3P23760 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAX3P23760 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAX3P23760 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAX3P23760 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAX3P23760 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAX3P23760 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAX3P23760 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PAX3P23760 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAX3P23760 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAX3P23760 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAX3P23760 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAX3P23760 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAX3P23760 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAX3P23760 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAX3P23760 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAX3P23760 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAX3P23760 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PAX3P23760 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAX3P23760 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAX3P23760 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAX3P23760 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PAX3P23760 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PAX3P23760 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PAX3P23760 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PAX3P23760 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PAX3P23760 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PAX3P23760 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PAX3P23760 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PAX3P23760 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PAX3P23760 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PAX3P23760 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAX3P23760 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAX3P23760 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAX3P23760 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAX3P23760 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAX3P23760 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAX3P23760 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAX3P23760 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAX3P23760 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAX3P23760 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAX3P23760 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAX3P23760 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAX3P23760 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAX3P23760 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAX3P23760 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAX3P23760 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PAX3P23760 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAX3P23760 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAX3P23760 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAX3P23760 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAX3P23760 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PAX3P23760 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAX3P23760 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAX3P23760 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAX3P23760 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAX3P23760 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAX3P23760 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAX3P23760 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAX3P23760 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAX3P23760 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAX3P23760 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAX3P23760 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAX3P23760 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAX3P23760 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAX3P23760 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAX3P23760 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PAX3P23760 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAX3P23760 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PAX3P23760 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PAX3P23760 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PAX3P23760 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PAX3P23760 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PAX3P23760 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PAX3P23760 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAX3P23760 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAX3P23760 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAX3P23760 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAX3P23760 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAX3P23760 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAX3P23760 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAX3P23760 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAX3P23760 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAX3P23760 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAX3P23760 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAX3P23760 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAX3P23760 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAX3P23760 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAX3P23760 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAX3P23760 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAX3P23760 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAX3P23760 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAX3P23760 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAX3P23760 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAX3P23760 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAX3P23760 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAX3P23760 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAX3P23760 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAX3P23760 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAX3P23760 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms