Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2B4P23634 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2B4P23634 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP2B4P23634 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2B4P23634 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2B4P23634 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2B4P23634 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2B4P23634 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2B4P23634 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2B4P23634 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2B4P23634 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2B4P23634 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2B4P23634 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2B4P23634 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2B4P23634 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2B4P23634 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2B4P23634 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2B4P23634 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP2B4P23634 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP2B4P23634 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP2B4P23634 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP2B4P23634 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP2B4P23634 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP2B4P23634 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B4P23634 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B4P23634 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B4P23634 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B4P23634 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B4P23634 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B4P23634 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B4P23634 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B4P23634 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms