Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPAP23025 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPAP23025 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPAP23025 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPAP23025 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPAP23025 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPAP23025 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPAP23025 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPAP23025 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPAP23025 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPAP23025 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPAP23025 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPAP23025 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPAP23025 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPAP23025 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPAP23025 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPAP23025 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPAP23025 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPAP23025 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPAP23025 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPAP23025 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPAP23025 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPAP23025 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPAP23025 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPAP23025 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPAP23025 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPAP23025 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPAP23025 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPAP23025 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPAP23025 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPAP23025 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPAP23025 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPAP23025 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPAP23025 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPAP23025 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPAP23025 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPAP23025 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPAP23025 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPAP23025 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPAP23025 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPAP23025 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPAP23025 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPAP23025 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPAP23025 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPAP23025 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
XPAP23025 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPAP23025 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPAP23025 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPAP23025 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPAP23025 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPAP23025 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPAP23025 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
XPAP23025 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPAP23025 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPAP23025 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPAP23025 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPAP23025 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPAP23025 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPAP23025 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
XPAP23025 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPAP23025 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPAP23025 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPAP23025 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPAP23025 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPAP23025 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPAP23025 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPAP23025 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPAP23025 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPAP23025 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPAP23025 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPAP23025 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPAP23025 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPAP23025 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPAP23025 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
XPAP23025 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPAP23025 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPAP23025 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
XPAP23025 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPAP23025 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
XPAP23025 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
XPAP23025 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
XPAP23025 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
XPAP23025 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPAP23025 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
XPAP23025 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
XPAP23025 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPAP23025 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPAP23025 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPAP23025 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPAP23025 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPAP23025 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPAP23025 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPAP23025 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPAP23025 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPAP23025 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPAP23025 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPAP23025 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPAP23025 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPAP23025 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPAP23025 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms