Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BCL3P20749 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BCL3P20749 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BCL3P20749 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BCL3P20749 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BCL3P20749 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BCL3P20749 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BCL3P20749 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BCL3P20749 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BCL3P20749 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BCL3P20749 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BCL3P20749 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BCL3P20749 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BCL3P20749 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BCL3P20749 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BCL3P20749 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BCL3P20749 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BCL3P20749 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BCL3P20749 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BCL3P20749 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BCL3P20749 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BCL3P20749 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BCL3P20749 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BCL3P20749 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BCL3P20749 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BCL3P20749 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BCL3P20749 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCL3P20749 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCL3P20749 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCL3P20749 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCL3P20749 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCL3P20749 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCL3P20749 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCL3P20749 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCL3P20749 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BCL3P20749 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BCL3P20749 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BCL3P20749 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BCL3P20749 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BCL3P20749 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BCL3P20749 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BCL3P20749 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BCL3P20749 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BCL3P20749 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BCL3P20749 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BCL3P20749 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCL3P20749 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCL3P20749 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCL3P20749 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCL3P20749 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCL3P20749 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCL3P20749 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCL3P20749 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCL3P20749 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BCL3P20749 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCL3P20749 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCL3P20749 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCL3P20749 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCL3P20749 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCL3P20749 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BCL3P20749 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BCL3P20749 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BCL3P20749 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BCL3P20749 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BCL3P20749 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BCL3P20749 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BCL3P20749 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BCL3P20749 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BCL3P20749 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BCL3P20749 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BCL3P20749 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BCL3P20749 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BCL3P20749 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BCL3P20749 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BCL3P20749 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BCL3P20749 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BCL3P20749 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BCL3P20749 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BCL3P20749 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BCL3P20749 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BCL3P20749 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BCL3P20749 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BCL3P20749 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BCL3P20749 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BCL3P20749 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BCL3P20749 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BCL3P20749 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BCL3P20749 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BCL3P20749 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BCL3P20749 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BCL3P20749 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BCL3P20749 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BCL3P20749 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BCL3P20749 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BCL3P20749 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BCL3P20749 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BCL3P20749 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BCL3P20749 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BCL3P20749 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BCL3P20749 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms