Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXA5P20719 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA5P20719 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms