Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATF1P18846 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATF1P18846 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATF1P18846 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATF1P18846 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATF1P18846 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATF1P18846 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATF1P18846 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATF1P18846 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATF1P18846 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATF1P18846 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATF1P18846 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATF1P18846 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATF1P18846 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATF1P18846 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATF1P18846 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATF1P18846 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATF1P18846 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATF1P18846 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATF1P18846 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATF1P18846 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATF1P18846 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATF1P18846 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATF1P18846 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATF1P18846 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATF1P18846 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATF1P18846 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATF1P18846 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATF1P18846 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATF1P18846 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATF1P18846 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATF1P18846 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATF1P18846 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATF1P18846 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATF1P18846 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATF1P18846 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATF1P18846 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATF1P18846 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATF1P18846 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATF1P18846 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATF1P18846 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATF1P18846 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATF1P18846 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATF1P18846 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATF1P18846 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATF1P18846 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATF1P18846 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATF1P18846 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATF1P18846 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATF1P18846 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATF1P18846 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATF1P18846 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATF1P18846 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATF1P18846 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATF1P18846 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATF1P18846 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATF1P18846 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATF1P18846 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATF1P18846 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATF1P18846 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATF1P18846 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATF1P18846 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATF1P18846 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATF1P18846 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATF1P18846 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATF1P18846 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATF1P18846 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATF1P18846 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATF1P18846 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATF1P18846 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATF1P18846 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATF1P18846 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATF1P18846 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATF1P18846 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATF1P18846 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATF1P18846 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATF1P18846 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATF1P18846 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATF1P18846 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATF1P18846 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATF1P18846 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATF1P18846 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATF1P18846 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATF1P18846 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATF1P18846 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATF1P18846 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATF1P18846 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATF1P18846 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATF1P18846 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATF1P18846 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATF1P18846 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATF1P18846 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATF1P18846 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATF1P18846 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATF1P18846 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATF1P18846 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATF1P18846 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATF1P18846 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATF1P18846 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATF1P18846 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms