Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB9P17482 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HOXB9P17482 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXB9P17482 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms