Protein–RNA interactions for Protein: P16389

KCNA2, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA2P16389 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNA2P16389 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNA2P16389 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNA2P16389 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNA2P16389 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNA2P16389 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNA2P16389 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNA2P16389 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNA2P16389 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNA2P16389 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNA2P16389 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNA2P16389 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNA2P16389 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNA2P16389 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNA2P16389 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNA2P16389 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNA2P16389 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNA2P16389 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNA2P16389 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNA2P16389 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNA2P16389 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNA2P16389 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNA2P16389 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNA2P16389 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNA2P16389 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNA2P16389 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNA2P16389 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNA2P16389 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNA2P16389 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNA2P16389 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNA2P16389 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNA2P16389 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNA2P16389 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNA2P16389 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNA2P16389 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNA2P16389 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNA2P16389 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNA2P16389 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNA2P16389 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNA2P16389 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNA2P16389 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNA2P16389 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNA2P16389 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNA2P16389 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms