Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCFC2P16383 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCFC2P16383 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GCFC2P16383 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCFC2P16383 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCFC2P16383 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GCFC2P16383 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GCFC2P16383 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GCFC2P16383 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
GCFC2P16383 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCFC2P16383 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCFC2P16383 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms