Protein–RNA interactions for Protein: P15918

RAG1, V(D)J recombination-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG1P15918 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAG1P15918 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAG1P15918 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAG1P15918 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAG1P15918 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAG1P15918 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAG1P15918 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAG1P15918 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAG1P15918 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RAG1P15918 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAG1P15918 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAG1P15918 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAG1P15918 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RAG1P15918 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAG1P15918 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAG1P15918 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAG1P15918 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAG1P15918 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAG1P15918 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RAG1P15918 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAG1P15918 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RAG1P15918 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAG1P15918 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAG1P15918 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAG1P15918 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAG1P15918 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAG1P15918 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAG1P15918 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAG1P15918 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAG1P15918 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAG1P15918 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAG1P15918 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAG1P15918 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAG1P15918 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAG1P15918 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RAG1P15918 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RAG1P15918 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAG1P15918 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAG1P15918 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAG1P15918 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAG1P15918 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAG1P15918 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAG1P15918 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAG1P15918 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAG1P15918 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RAG1P15918 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAG1P15918 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAG1P15918 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAG1P15918 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAG1P15918 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAG1P15918 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAG1P15918 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAG1P15918 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAG1P15918 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAG1P15918 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAG1P15918 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAG1P15918 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAG1P15918 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAG1P15918 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAG1P15918 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAG1P15918 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAG1P15918 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAG1P15918 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAG1P15918 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAG1P15918 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAG1P15918 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAG1P15918 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAG1P15918 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAG1P15918 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAG1P15918 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAG1P15918 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAG1P15918 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAG1P15918 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAG1P15918 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAG1P15918 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAG1P15918 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAG1P15918 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAG1P15918 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAG1P15918 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAG1P15918 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAG1P15918 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAG1P15918 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAG1P15918 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAG1P15918 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAG1P15918 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAG1P15918 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RAG1P15918 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAG1P15918 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAG1P15918 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAG1P15918 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAG1P15918 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAG1P15918 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAG1P15918 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RAG1P15918 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAG1P15918 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAG1P15918 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAG1P15918 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAG1P15918 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAG1P15918 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAG1P15918 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms