Protein–RNA interactions for Protein: P15374

UCHL3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL3P15374 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
UCHL3P15374 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UCHL3P15374 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms