Protein–RNA interactions for Protein: P15172

MYOD1, Myoblast determination protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOD1P15172 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MYOD1P15172 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYOD1P15172 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MYOD1P15172 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms