Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SLC5A1P13866 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC5A1P13866 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms