Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
CFTRP13569 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
CFTRP13569 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
CFTRP13569 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC40.41■■■■■ 4.06
CFTRP13569 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
CFTRP13569 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CFTRP13569 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CFTRP13569 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
CFTRP13569 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
CFTRP13569 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
CFTRP13569 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CFTRP13569 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CFTRP13569 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC40.39■■■■■ 4.06
CFTRP13569 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
CFTRP13569 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CFTRP13569 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
CFTRP13569 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
CFTRP13569 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
CFTRP13569 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
CFTRP13569 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CFTRP13569 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
CFTRP13569 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CFTRP13569 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
CFTRP13569 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
CFTRP13569 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
CFTRP13569 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
CFTRP13569 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
CFTRP13569 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
CFTRP13569 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
CFTRP13569 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
CFTRP13569 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
CFTRP13569 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CFTRP13569 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
CFTRP13569 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
CFTRP13569 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CFTRP13569 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CFTRP13569 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CFTRP13569 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
CFTRP13569 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CFTRP13569 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
CFTRP13569 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CFTRP13569 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CFTRP13569 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CFTRP13569 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CFTRP13569 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CFTRP13569 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
CFTRP13569 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CFTRP13569 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CFTRP13569 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
CFTRP13569 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
CFTRP13569 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC40.32■■■■■ 4.05
CFTRP13569 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.04
CFTRP13569 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.04
CFTRP13569 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CFTRP13569 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CFTRP13569 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
CFTRP13569 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
CFTRP13569 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CFTRP13569 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
CFTRP13569 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
CFTRP13569 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CFTRP13569 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
CFTRP13569 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
CFTRP13569 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
CFTRP13569 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
CFTRP13569 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC40.28■■■■■ 4.04
CFTRP13569 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC40.28■■■■■ 4.04
CFTRP13569 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
CFTRP13569 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
CFTRP13569 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
CFTRP13569 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
CFTRP13569 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
CFTRP13569 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
CFTRP13569 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
CFTRP13569 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CFTRP13569 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CFTRP13569 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CFTRP13569 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
CFTRP13569 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CFTRP13569 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CFTRP13569 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CFTRP13569 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CFTRP13569 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
CFTRP13569 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CFTRP13569 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CFTRP13569 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CFTRP13569 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
CFTRP13569 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CFTRP13569 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CFTRP13569 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CFTRP13569 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
CFTRP13569 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
CFTRP13569 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CFTRP13569 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
CFTRP13569 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
CFTRP13569 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
CFTRP13569 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
CFTRP13569 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
CFTRP13569 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
CFTRP13569 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms