Protein–RNA interactions for Protein: P13236

CCL4, C-C motif chemokine 4, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4P13236 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL4P13236 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCL4P13236 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCL4P13236 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL4P13236 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL4P13236 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL4P13236 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL4P13236 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL4P13236 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCL4P13236 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCL4P13236 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCL4P13236 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCL4P13236 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCL4P13236 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCL4P13236 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCL4P13236 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCL4P13236 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCL4P13236 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCL4P13236 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCL4P13236 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCL4P13236 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCL4P13236 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL4P13236 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL4P13236 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL4P13236 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL4P13236 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL4P13236 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL4P13236 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL4P13236 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL4P13236 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCL4P13236 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL4P13236 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL4P13236 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL4P13236 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL4P13236 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL4P13236 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL4P13236 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL4P13236 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL4P13236 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL4P13236 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCL4P13236 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL4P13236 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL4P13236 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL4P13236 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL4P13236 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL4P13236 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL4P13236 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL4P13236 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL4P13236 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCL4P13236 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL4P13236 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL4P13236 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL4P13236 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL4P13236 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL4P13236 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL4P13236 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL4P13236 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL4P13236 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL4P13236 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL4P13236 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL4P13236 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL4P13236 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL4P13236 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL4P13236 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL4P13236 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL4P13236 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL4P13236 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL4P13236 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL4P13236 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL4P13236 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL4P13236 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL4P13236 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL4P13236 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL4P13236 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL4P13236 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL4P13236 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL4P13236 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL4P13236 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL4P13236 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL4P13236 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL4P13236 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL4P13236 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL4P13236 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL4P13236 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL4P13236 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL4P13236 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL4P13236 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL4P13236 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL4P13236 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL4P13236 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCL4P13236 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCL4P13236 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCL4P13236 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCL4P13236 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCL4P13236 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCL4P13236 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCL4P13236 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCL4P13236 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCL4P13236 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCL4P13236 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms