Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACTN1P12814 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACTN1P12814 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTN1P12814 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 233.1 ms