Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CKBP12277 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CKBP12277 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CKBP12277 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CKBP12277 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CKBP12277 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CKBP12277 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CKBP12277 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CKBP12277 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CKBP12277 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CKBP12277 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKBP12277 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKBP12277 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKBP12277 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CKBP12277 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKBP12277 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CKBP12277 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKBP12277 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKBP12277 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKBP12277 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKBP12277 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CKBP12277 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKBP12277 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKBP12277 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKBP12277 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKBP12277 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKBP12277 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKBP12277 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKBP12277 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKBP12277 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKBP12277 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKBP12277 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKBP12277 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CKBP12277 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CKBP12277 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CKBP12277 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CKBP12277 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CKBP12277 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CKBP12277 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CKBP12277 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CKBP12277 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CKBP12277 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CKBP12277 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CKBP12277 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CKBP12277 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CKBP12277 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CKBP12277 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CKBP12277 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CKBP12277 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CKBP12277 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CKBP12277 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CKBP12277 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CKBP12277 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CKBP12277 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CKBP12277 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CKBP12277 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CKBP12277 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CKBP12277 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CKBP12277 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CKBP12277 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CKBP12277 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CKBP12277 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CKBP12277 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CKBP12277 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CKBP12277 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CKBP12277 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CKBP12277 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CKBP12277 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CKBP12277 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CKBP12277 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CKBP12277 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CKBP12277 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CKBP12277 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CKBP12277 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CKBP12277 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CKBP12277 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CKBP12277 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CKBP12277 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CKBP12277 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CKBP12277 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CKBP12277 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CKBP12277 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CKBP12277 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CKBP12277 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CKBP12277 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CKBP12277 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CKBP12277 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CKBP12277 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CKBP12277 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CKBP12277 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CKBP12277 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CKBP12277 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CKBP12277 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CKBP12277 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CKBP12277 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CKBP12277 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CKBP12277 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CKBP12277 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CKBP12277 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CKBP12277 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms