Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL6A2P12110 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL6A2P12110 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL6A2P12110 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms