Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VPREB1P12018 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VPREB1P12018 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms