Protein–RNA interactions for Protein: P11473

VDR, Vitamin D3 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDRP11473 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VDRP11473 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VDRP11473 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VDRP11473 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VDRP11473 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VDRP11473 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VDRP11473 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VDRP11473 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VDRP11473 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VDRP11473 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VDRP11473 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VDRP11473 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VDRP11473 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VDRP11473 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
VDRP11473 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VDRP11473 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VDRP11473 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
VDRP11473 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VDRP11473 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VDRP11473 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VDRP11473 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VDRP11473 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
VDRP11473 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VDRP11473 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VDRP11473 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VDRP11473 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VDRP11473 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
VDRP11473 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VDRP11473 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VDRP11473 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VDRP11473 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VDRP11473 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VDRP11473 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VDRP11473 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VDRP11473 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VDRP11473 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VDRP11473 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VDRP11473 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VDRP11473 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VDRP11473 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VDRP11473 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VDRP11473 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VDRP11473 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VDRP11473 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VDRP11473 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VDRP11473 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VDRP11473 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VDRP11473 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VDRP11473 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VDRP11473 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VDRP11473 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VDRP11473 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VDRP11473 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VDRP11473 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VDRP11473 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VDRP11473 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
VDRP11473 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VDRP11473 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
VDRP11473 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VDRP11473 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VDRP11473 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VDRP11473 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VDRP11473 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VDRP11473 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VDRP11473 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VDRP11473 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VDRP11473 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VDRP11473 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VDRP11473 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VDRP11473 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VDRP11473 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VDRP11473 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VDRP11473 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VDRP11473 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VDRP11473 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VDRP11473 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VDRP11473 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VDRP11473 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VDRP11473 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VDRP11473 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VDRP11473 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VDRP11473 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VDRP11473 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VDRP11473 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VDRP11473 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VDRP11473 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VDRP11473 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VDRP11473 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VDRP11473 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VDRP11473 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VDRP11473 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VDRP11473 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VDRP11473 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VDRP11473 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VDRP11473 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VDRP11473 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VDRP11473 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VDRP11473 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VDRP11473 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VDRP11473 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms