Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD28P10747 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD28P10747 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD28P10747 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD28P10747 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD28P10747 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD28P10747 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD28P10747 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD28P10747 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD28P10747 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD28P10747 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD28P10747 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD28P10747 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD28P10747 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD28P10747 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD28P10747 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD28P10747 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD28P10747 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD28P10747 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD28P10747 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD28P10747 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD28P10747 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD28P10747 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD28P10747 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD28P10747 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD28P10747 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD28P10747 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD28P10747 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD28P10747 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD28P10747 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD28P10747 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD28P10747 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD28P10747 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD28P10747 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD28P10747 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD28P10747 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD28P10747 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD28P10747 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD28P10747 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD28P10747 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CD28P10747 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD28P10747 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD28P10747 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD28P10747 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD28P10747 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD28P10747 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD28P10747 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CD28P10747 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CD28P10747 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CD28P10747 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD28P10747 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CD28P10747 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD28P10747 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD28P10747 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD28P10747 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD28P10747 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD28P10747 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD28P10747 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD28P10747 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD28P10747 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD28P10747 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD28P10747 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD28P10747 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD28P10747 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD28P10747 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD28P10747 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD28P10747 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD28P10747 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD28P10747 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD28P10747 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD28P10747 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD28P10747 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD28P10747 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD28P10747 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD28P10747 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD28P10747 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD28P10747 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD28P10747 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD28P10747 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD28P10747 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CD28P10747 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD28P10747 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD28P10747 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD28P10747 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CD28P10747 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD28P10747 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD28P10747 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD28P10747 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD28P10747 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD28P10747 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CD28P10747 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD28P10747 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD28P10747 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD28P10747 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD28P10747 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD28P10747 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD28P10747 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD28P10747 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD28P10747 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD28P10747 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms